蒸汽鍋爐內部產生水垢后會有一系列的不良后果發生，尤其是由于水垢的導熱性很差，所以蒸汽鍋爐結垢后就會嚴重阻礙傳熱。

一旦蒸汽鍋爐因結垢而嚴重影響受熱面傳熱，隨之而來的就是降低熱效率，減少蒸汽出力，增加燃料消耗。由于氣價格高，因此燃氣蒸汽鍋爐結垢后造成的浪費和損失將大大高于燃煤蒸汽鍋爐。

特別是當蒸汽鍋爐的受熱面結生水垢后，金屬的熱量由于受水垢的阻礙而難于傳遞給鍋水，致使溫度急劇升高，材料強度顯著降低，從而導致金屬過熱變形甚至還會發生鼓包、裂縫、甚至爆破等事故。

如果蒸汽熱水鍋爐內水管內結垢，就會減小流通截面積，增加水的流動阻力，破壞正常的水循環，嚴重時還會完全堵塞管道，造成爆管事故。另外，縮短使用壽命也是蒸汽鍋爐結垢的危害之一。